Alignment of all assigned haplotypes
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F1              AACCCTCC--------CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
F2              AACCCTCCTCCCCTCCCCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
F3              AACCCTCCTCCCCTCCCCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C1              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
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C2              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
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C11             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C13             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C3              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C17             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C14             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C19             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C5              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C6              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C16             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C20             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C10             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
C12             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
E1              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAGTGGTTTGCCCC
E3              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAGTGGTTTGCCCC
E4              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAGTGGTTTGCCCC
E2              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAGTGGTTTGCCCC
B1              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B21             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B19             AATCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B20             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B3              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
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B14             ACCCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B17             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B34             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B46             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B15             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B2              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B40             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
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B26             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B32             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B4              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B16             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B47             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGCTTGCCCC
B25             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B5              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B23             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B22             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B24             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAGTGGTTTGCCCC
B29             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAGTGGTTTGCCCC
B12             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAGTGGTTTGCCCC
B11             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B18             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B35             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B39             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B13             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B9              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B30             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B41             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
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B7              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B8              AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B33             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
B48             AACCCTTCTTCCCTC-CCCT-----------ATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCC
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